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数字PCR(二)— Bio-rad ddPCR

作者:百变鹏仔日期:2023-08-29 19:10:39浏览:11分类:文字大全

数字PCR(二)— Bio-rad ddPCR

数字PCR可以直接计算目标序列的拷贝数,因此无需依赖于对照样品和标准曲线就可以进行精确的绝对定量检测;此外,由于数字PCR在进行结果判读时仅判断有/无两种扩增状态,因此也不需要检测荧光信号与设定阈值线的交点,完全不依赖于Ct值的鉴定,因此数字PCR的反应受扩增效率的影响大大降低,对PCR反应抑制物的耐受能力大大提高;数字PCR实验中标准反应体系分配的过程可以极大程度上降低与目标序列有竞争性作用的背景序列浓度,因此数字PCR技术也特别适合在复杂背景中检测稀有突变

A:最低微滴上样量是和您的实验的突变比例灵敏度需求相关的,人类cfDNA的具体上样需求,可见下表

A:按照泊松分布原理,小于等于5 copies/droplet(100000copies/20ul)的核酸浓度,都能保证总体内有空余微滴存在,通过统计学换算,都可以保证结果稳定,并非必须要求每个微滴单拷贝。20,000个微滴对应的是100,000个拷贝的核酸。即使总微滴数有损失,一般15,000个微滴对应的检测上限也应该是75,000个拷贝。

理论上讲只要有还有1个阴性微滴,ddPCR基于Possion分布都能计算出样本的含量,但是CV%会非常大。可以接受的动态范围是CV%

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